科学家绘出人类与病毒蛋白质间相互作用图谱

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哥伦比亚大学的研究人员已经开发出一种计算框架,用于推断病毒蛋白质和人类蛋白质之间的相互作用,使用这种方法获得有关病毒如何感染人类以及绘制所有可感染人类的已知人类的大量信息。病毒与其感染细胞相互作用的图谱。相关论文发表在最近的《细胞》杂志上。

病毒是细胞中的寄生微生物,其通过蛋白质 - 蛋白质相互作用使用细胞机制,并且细胞还依赖于该作用来启动响应病毒入侵的免疫应答机制。因此,了解蛋白质之间的相互作用对于理解病毒与宿主细胞之间的关系至关重要。

目前,科学家们主要通过高通量方法研究蛋白质之间的相互作用。虽然已经获得了许多新的发现,但这种方法缺乏可扩展性也限制了研究。这一次,哥伦比亚大学研究人员开发的计算框架P-HIPSTer使用蛋白质结构信息来推断病毒蛋白质与人类蛋白质之间的相互作用,这可以有效地弥补高通量方法缺乏可扩展性。

通过P-HIPSTer,研究人员研究了1000多种已知的人类感染病毒和大约13,000种由它们编码的蛋白质,最后绘制了人类病毒蛋白质相互作用图谱。该图涵盖了大约282,000种可能的相互作用蛋白质对,所揭示的生物信息对人类免疫学和传染病研究具有重要价值。

除了确认人类病毒蛋白质相互作用外,P-HIPSTer还为研究人员提供了大量关于病毒如何感染人体细胞并引起疾病的信息,包括雌激素受体在调节寨卡病毒感染,人类乳头状瘤中的作用。病毒如何导致癌症,病毒如何影响人类基因组等等。

研究人员表示,科学家对病毒蛋白与人类蛋白质之间的相互作用缺乏深入的了解。他们希望新的地图将为科学界提供更多的研究资源,并帮助科学家获得更多的生物信息。接下来,他们打算用P-HIPSTer研究更复杂的病原体,如寄生虫和细菌;将来,他们可能会使用这种工具来研究影响作物或牲畜的病毒或病原体。 (记者刘海英)

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